招标代理机构的确定方式主要依据《中华人民共和国政府采购法》和《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规。根据这些法律，招标人有权自行选择招标代理机构，委托其办理招标事宜，且任何单位和个人不得以任何方式为招标人指定招标代理机构。
具体确定方式可以归纳为以下几种：
直接指定法
采购人可以直接指定一家招标代理机构来办理政府采购事宜。这种方式操作简便快捷，但可能缺乏透明度和竞争性。
参照政府采购程序
采购人可以通过政府采购程序来选择招标代理机构。这种方式程序较为繁琐，采购周期较长，但较为规范。
通过比选等简易政府采购程序择优选择
采购人可以通过比选等方式，从多家招标代理机构中择优选择。这种方式高效、灵活，能够较好地平衡效率和竞争性。
遴选入围建库
采购人可以通过遴选的方式选择多家招标代理机构，组成代理机构库。在使用时，直接从库中指定某一家代理机构。这种方式能够确保代理机构的质量和竞争性，但需要建立和维护一个较为复杂的代理机构库。
公开招标
招标人应在行业主管部门和招投标综合监管部门的监督下，通过公开招标方式选定招标代理机构，并依法签订委托代理协议。这种方式确保了招标过程的公开、公平和公正，适用于招标金额较大、社会影响较广的项目。
随机抽取法
对于投资规模在5000万元以下的工程项目，招标人可以通过政府指定媒介公布公告，从报名的招标代理机构中随机抽取一家。这种方式操作简单，能够有效防止腐败和暗箱操作。
综合评估法
招标人可以根据工程规模、项目特点等因素，对投标的招标代理机构进行综合评估，选择综合实力最强的机构。这种方式能够全面考虑代理机构的各项资质和能力，但需要制定详细的评估标准和流程。
邀请招标
招标人可以向特定的一些招标代理机构发出邀请，通过资格审查、价格、初步招标方案等方面的评审，确定委托哪家代理机构进行招标工作。这种方式适用于一些专业性较强、潜在投标人数量有限的项目。
竞争性谈判
招标人可以通过竞争性谈判的方式，与多家招标代理机构进行谈判，最终选择最符合项目需求的机构。这种方式能够较好地了解各家的实际能力和报价，但需要投入较多时间和精力。
在选择招标代理机构时，建议采购人综合考虑项目的特点、代理机构的专业领域、资质、业绩、服务质量和费用等因素，自主择优选择，以确保招标过程的公正、高效和合规性。
