水利建设基金的计算方法如下：
按照营业收入的千分之一缴纳
水利建设基金可以按照企业营业收入的千分之一来计算缴纳。
根据水利工程总投资分担比例收取
水利建设基金的计算方法还可以根据水利工程总投资的不同比例来收取，具体计算过程包括确定水利工程规模、工程概算法计算不同项目投资、根据地区规定确定收取比例及最终根据总概算金额和确定比例计算出水利建设基金的数额。
按上月销售收入或营业收入的3%计征
另一种计算水利建设基金的方法是按上月销售收入或营业收入的3%来计征。
按照增值税、消费税实际缴纳额的1%来计提和交纳
水利建设基金还可以按照增值税、消费税实际缴纳额的1%来计提和交纳。
建议
具体采用哪种计算方法，需要参照当地的具体政策和规定。
企业在计算水利建设基金时，应确保按照相关法规和规定进行，以符合法律法规要求。
