参公单位的事业编与事业单位的事业编之间存在几个主要的区别：
执法资格
参公人员具有执法资格，可以执行公务，而普通事业单位人员通常没有执法资格。
编制性质
虽然参公单位使用的是事业编制，但参公人员参照公务员法管理，与普通事业编制人员在编制性质上有本质区别。参公人员不是正式的行政编制，但在管理模式和待遇方面与公务员相似。
进入门槛
参公事业编制人员需要通过公务员考试录用，与普通事业编制人员通过事业单位统一考试录用相比，门槛更高。
待遇
参公事业编制人员的待遇与公务员相近，包括工资待遇、车补和年终绩效奖等，而普通事业编制人员的待遇通常较低，尤其在车补和年终绩效方面。
管理模式
参公事业编制人员参照公务员法管理，享有与公务员相似的管理和晋升方式，而普通事业编制人员则按照事业单位工作人员的相关法律法规进行管理。
晋升方式
参公事业编制人员通常有职务和职级两个晋升序列，晋升方式与公务员类似，而普通事业编制人员主要在各自岗位上晋升，管理岗可以兼任专业技术岗。
流动性和身份
参公事业编制人员可以在参公单位和行政机关之间自由流动，身份待遇明显高于普通事业编制人员。普通事业编制人员流动性相对较低。
改革
参公事业单位主要集中在行政类事业单位和执法类事业机构，其中行政类事业单位在本轮党政机构改革中已经全部清理，并入行政机关作为内设机构或改为公益类事业单位。执法类事业机构暂时不列入改革范畴，而其他事业单位将按照事业单位分类改革要求完成改革。
总结来说，参公单位的事业编在执法资格、编制性质、进入门槛、待遇、管理模式、晋升方式、流动性和改革方面与普通事业单位的事业编存在显著差异。参公事业编制人员虽然使用事业编制，但管理模式和待遇更接近公务员，具有较高的身份和待遇优势。
