名侦探柯南中黑衣组织出场的集数如下：
1. 第129集《铁路警察组织杀人事件》
2. 第176集《与黑衣组织的再会（灰原篇）》
3. 第177集《与黑衣组织的再会（柯南篇）》
4. 第178集《与黑衣组织的再会（解决篇）》
5. 第230集《神秘的乘客（前篇）》
6. 第231集《神秘的乘客（后篇）》
7. 第271集《急忙掩饰的忽略（前篇）》
8. 第272集《急忙掩饰的忽略（后篇）》
9. 第286集《工藤新一纽约事件（事件篇）》
10. 第288集《工藤新一纽约事件（解决篇）》
11. 第289集《光彦森林迷失记（前篇）》
12. 第307集《无声的证据（前篇）》
13. 第308集《无声的证据（后篇）》
14. 第309集《同黑暗组织的接触（交涉篇）》
15. 第310集《同黑暗组织的接触（追迹篇）》
16. 第311集《同黑暗组织的接触（解决篇）》
建议观看时结合集数信息，以获取黑衣组织出场的完整情况。
