通行费电子普通发票可以抵扣，但需要满足一定条件。以下是具体的抵扣规定：
征税的通行费增值税电子普通发票 ：可以通过发票勾选平台勾选抵扣，发票左上角会有“通行费”字样。税务机关监制的桥、闸通行费纸质发票：
可以计算抵扣，公式为：可抵扣进项税额 = 支付金额 ÷ （1+5%） × 5%。
纳税人支付的道路、桥、闸通行费
自2018年1月1日起，纳税人支付的道路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。
2018年1月1日至12月31日，纳税人支付的一级、二级公路通行费，如暂未能取得收费公路通行费增值税电子普通发票，可凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照公式计算可抵扣进项税额：一级、二级公路通行费可抵扣进项税额 = 一级、二级公路通行费发票上注明的金额 ÷ （1+5%） × 5%。
纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照公式计算可抵扣的进项税额：桥、闸通行费可抵扣进项税额 = 桥、闸通行费发票上注明的金额 ÷ （1+5%） × 5%。
增值税一般纳税人购进国内旅客运输服务：
取得增值税电子普通发票的，其注明的增值税额准予从销项税额中抵扣。
企业车辆通行费用的电子普通发票：
可以凭借发票上的税额进行抵扣，但需要符合相关税收及非税收政策规定。
购买及使用方：
必须具有合法注册企业资格，完成税务登记，并具有税号，发票类型需为增值税普通发票，且抵扣项目需符合相关税收及非税收政策规定。
通行费电子普通发票的分类：
分为征税发票和不征税发票两种，增值税一般纳税人可以通过本地增值税发票选择确认平台进行通行费电子发票抵扣，也可以前往主管国税机关办税服务厅，由相关工作人员辅助其进行通行费电子发票的抵扣。
综上所述，通行费电子普通发票可以抵扣，但需要满足上述条件，包括发票类型、纳税人资格、抵扣项目等。建议纳税人在实际操作中仔细核对相关政策和规定，以确保合规抵扣。
