工程设计费的收费标准主要参照《工程勘察设计收费管理规定》（计价格10号）。具体收费方式如下：
工程设计收费基价
工程设计收费基价是完成基本服务的价格，根据计费额所在相对应的区间内用插入法计算设计收费基价。
调整系数
专业调整系数：根据工程所属行业的不同而有所调整。
工程复杂程度调整系数：根据工程的复杂程度不同而有所调整，如III级工程复杂程度对应的系数为1.15。
附加调整系数：根据具体情况而定。
折扣：根据合同约定，可以在一定范围内对设计收费进行折扣。
计算公式
工程设计收费 = 工程设计收费基价 × 专业调整系数 × 工程复杂程度调整系数 × 附加调整系数 × 折扣。
示例计算
以某房屋建筑工程项目为例，工程复杂程度为III级，计费额为12800万元，按照计价格10号标准打5折，计算项目工程设计收费（不计其他设计收费）：
设计基价表：
估算投资10000万元~20000万元，收费304.8~566.8万元，计算费用基准价：（566.8-304.8）×（12800-10000）/（20000-10000）+304.8=378.16万元。
行业调整系数：
建筑市政工程-建筑、市政、电信工程：1.0。
复杂调整系数：
建筑市政工程-7.3.1建筑、人防工程-III级：1.15。
附加调整系数：
1。
折扣：
5折。
最终费用计算：378.16×1.0×1.15×1×0.5=217.442万元。
其他说明
其他设计收费：包括总体设计费、主体设计协调费、采用标准设计和复用设计费、非标准设备设计文件编制费、施工图预算编制费、竣工图编制费等。
特定情况下的调整：如只委托做工艺设计或土建及公用工程设计时，按照行业划分设计工作量各占的比例计算收费；只委托做初步设计或施工图设计时，按照行业划分设计工作量各占的比例并乘以1.1的系数计算收费；如果增加编制施工图预算，按工程设计收费标准乘以1.1系数计算收费等。
这些收费标准提供了一个基本的计算框架，但实际收费可能会根据具体项目的特点、地区差异以及双方的协商进行调整。
