运输企业适用的增值税税率根据不同的政策有所调整。以下是当前适用的税率：
一般纳税人
交通运输服务的增值税税率为9%。
国际运输服务与航天运输服务适用增值税零税率。
小规模纳税人
提供交通运输服务的征收率为3%。
特定情况下的调整
自2019年4月1日起，原税率为10%的运输服务，现税率调整为9%。
营改增后，运输业适用9%的税率，运费的结算普通发票所列运费金额，按照11%的扣除率计算进项税额的扣除。
建议：
运输企业在进行税务规划时，应确认其纳税人身份（一般纳税人或小规模纳税人），以便正确应用相应的税率。
对于提供国际运输服务的企业，可以利用零税率政策降低税负。
注意关注税收政策的变化，及时适应新的税率要求。
