圣安德鲁旗的来历与苏格兰的守护圣人圣安德鲁密切相关。圣安德鲁是耶稣的使徒之一，据传他因在希腊被钉死在X形的十字架上而得名，这个X形的十字架后来被称为圣安德鲁十字。
具体来说，圣安德鲁在希腊传教时被罗马当局处决，他请求不要采用耶稣的姿势钉死，而是采用X形的十字架。他的请求得到批准，因此X形十字架成为了他的象征。
公元832年，在苏格兰东海岸的Athelstaneford附近发生了一场战役，皮克特王Angus mac Fergus在战斗中处于下风，面临失败。在绝望中，他祈求神意，并在夜空中看到了如同圣安德鲁十字般的景象，认为这是神给他的旨意。于是，国王当即发誓，如果圣安德鲁帮助他获得胜利，那么从此以后圣安德鲁将成为苏格兰的保护神，而他的十字将成为苏格兰的国旗。
这场战役最终取得了胜利，圣安德鲁十字旗也理所应当地成为了苏格兰的国旗。尽管在1707年，英国国会决定放弃使用圣安德鲁十字旗，但在20世纪后半期，它被重新使用，并成为了苏格兰的法定国旗。
现在，圣安德鲁旗是苏格兰的重要象征，在国际比赛中所有的苏格兰参赛队都使用它，而且大部分公共建筑前的旗杆上也飘扬着该旗。
