根据《中华人民共和国未成年人保护法》的相关规定，学校在周六组织学生上课可能违法。以下是相关要点：
法律依据
根据《中华人民共和国未成年人保护法》第二十条，学校应当保证未成年学生的睡眠、娱乐和体育锻炼时间，不得加重其学习负担。
同法第三十七条指出，学校应当保证学生的课外活动时间，并组织开展文化娱乐等课外活动。
禁止规定
该法明确规定，学校不得利用双休日和法定节假日时间组织学生进行任何形式的集体补课。
对于义务教育阶段的未成年学生，学校不得占用国家法定节假日、休息日及寒暑假期进行集体补课。
特殊情况
如果学校组织的上课或补课是无偿的，并且未对学生造成过重的学习负担，这种行为可能不被视为违法。
学校为寄宿生和初中学生开设的自主学习晚自习，如果以学生自愿为原则，则可能不被视为违法。
处理方式
如发现学校违反上述规定，可以向当地的教育部门投诉。
总结来说，学校在周六组织学生上课，如果不符合上述法律条款的规定，尤其是涉及集体补课且加重学生负担的情况，通常是违法的。家长和学生如果发现此类情况，可以采取适当的法律行动来维护自己的权益。
