蝙蝠种类繁多，可以大致分为两大类：大蝙蝠和小蝙蝠。
大蝙蝠
狐蝠：世界上最大的蝙蝠种类，体型较一般蝙蝠大，两翼展开长达90厘米以上。头型似狐，口吻长而伸出，故称狐蝠。
菊头蝠：因嘴脸部特殊复杂的叶状突起而显著有别于其他类蝙蝠，为多种动物源病毒的重要宿主。群居岩洞，冬季冬眠于山洞深处，以昆虫及其幼虫为食。
蹄蝠：分布于旧大陆热带、亚热带地区，体型从微小到较大。有马蹄形的鼻叶，耳朵大小中等，没有耳屏。食多种多样的昆虫，常在洞穴中结成大群。
吸血蝙蝠：身体不大，没有外露的尾巴，毛色主要呈暗棕色。相貌丑恶，在天黑之后活动，吸食动物的血液。
小蝙蝠
果蝠：大翼手亚目的蝙蝠，仅有一科，即旧大陆（从非洲到太平洋岛屿）的果蝠，共有42属约170种。体型较大，身体结构较原始，以花果为食。
叶口蝠科、 吸血蝠科、 蝙蝠科等：这些科的小蝙蝠体型较小，身体结构更为特化，包括食虫、食肉和吸血等习性。
此外，还有一些特殊类型的蝙蝠，例如：
加纳饰肩果蝠：分布于赤道地区，看起来像长了翅膀的狗。
洪都拉斯幽灵蝙蝠：分布于中美洲低地雨林，长相最萌。
熊猫蝙蝠：外形与大熊猫相似，有独特的斑点和条纹。
金冠飞狐：世界上最大的蝙蝠，翼展可达1.5米，只吃素。
Chapin无尾蝙蝠：长着“莫西干发型”，是蝙蝠家族中的朋克非主流代表。
东方管鼻蝙蝠：牙齿与人类极度相似。
沙漠长耳蝙蝠：主要分布于北非和中东，喜欢吃蝎子。
犬吻蝠：长相奇丑无比，类似会飞的老鼠。
遮阳蝙蝠：头上有“遮阳板”，类似长鼻猴。
斗牛犬蝠：长相像斗牛犬。
这些蝙蝠种类在体型、食性、生活习性等方面均有很大差异，体现了蝙蝠世界的多样性。
