太监净身的过程极其痛苦且残忍，主要包括以下几个步骤：
前期准备
净身者需要提前三天排尽大小便，不吃不喝，被关在密闭的房间里。这段时间是为了确保手术时身体的清洁，避免排泄物污染伤口。
准备工具
主要工具有镰状弯刀、扎布、辣椒水、升（容器）、石灰、猪胆、大麦秆、熟鸡蛋等。这些工具在手术过程中各有其特定的用途，如消毒、止血、镇痛等。
割球球
净身者被绑在炕上，嘴里含一个熟鸡蛋以防止剧痛咬到舌头。然后开始动刀，在球囊左右各横割开一个深口子，割断筋络以便把球球（睾丸）挤出来。之后，将猪苦胆贴到球囊左右两边消毒止血。
割棍棍
把棍棍（阴茎）割掉，插上大麦秆，最后把猪苦胆劈开，呈蝴蝶状地敷在创口上。这一步骤需要极高的技术，以确保术后不会影响小便功能。
宝贝处理
割下来的宝贝（睾丸和阴茎）由净身师整齐地摆在升里，用石灰吸干水份。然后把净身契约用油纸包好放在升里，再用大红布把升口包好捆紧，挂到房梁上。有朝一日，净身人发了，可以赎回自己的宝贝。
术后处理
手术后，伤口用苦猪胆糊起来，猪胆粘粘的，糊起来血会止，也会消炎。手术后需要插上一根大麦秆，把另一个猪苦胆劈开，呈蝴蝶状地敷在创口上。术后三天内，被阉割者必须由人架持搀扶着在室内遛二至三个小时，然后方可横卧休息。这段时间内，被阉割者不能喝水，只能蘸点水湿润嘴唇。术后还需进行长期的调养和康复，大约需要百日左右。
整个净身过程对净身者的身体和心理都造成了极大的伤害，现代医学已经能够提供更为人道和安全的净身方法。
