小企业会计准则和企业制度的主要区别体现在以下几个方面：
适用范围
企业会计制度：适用于除金融保险企业以外的所有符合条件的大中型企业。
小企业会计准则：适用于在中华人民共和国境内依法设立的，经营规模符合国务院发布的《中小企业划型标准》所规定的小企业。
侧重点
企业会计制度：侧重于对会计要素的记录和报告作可操作性规范，确认和计量的内容只是有机地体现在会计科目及使用说明中。
小企业会计准则：在遵循《企业会计准则——基本准则》的大前提下，对小企业的会计确认、计量和报告进行了简化处理。
会计科目设置
企业会计制度：设置了85个一级科目。
小企业会计准则：设置了60个一级科目，其中有58个一级科目与《企业会计制度》的名称和内容基本相同，但小企业会计准则比企业会计准则少设了25个一级科目。
账务处理
企业会计制度：要求企业填制会计凭证、登记会计账簿、管理会计档案等，按照《中华人民共和国会计法》、《会计基础工作规范》和《会计档案管理办法》的规定执行。
小企业会计准则：在财产清查中发生资产的盘盈或盘亏时，直接进行处理，没有设置“待处理财产损溢”科目。
规范的目标和可操作性
企业会计准则：规范的目标主要是解决会计要素如何进行确认和计量的问题，同时也规范会计主体应当披露哪些方面的信息，规范的具体内容和可操作性强弱不同，要求会计人员具有较高的职业判断能力。
小企业会计准则：规范的目标主要是解决会计要素如何进行记录和报告的问题，规范的内容具体得多，可操作性较强，对会计人员的素质要求相对较低。
制定依据
企业会计制度和 小企业会计制度都是依据《中华人民共和国会计法》和其他有关法律法规制定的。
会计核算基础工作和前提条件
企业会计制度和 小企业会计制度都要求企业填制会计凭证、登记会计账簿、管理会计档案等，按照《中华人民共和国会计法》、《会计基础工作规范》和《会计档案管理办法》的规定执行，企业的会计核算应当以持续、正常的生产经营活动为前提。
会计核算应遵循的基本原则
企业会计制度和 小企业会计制度都要求企业遵循客观性原则、实质重于形式原则、相关性原则、一贯性原则、可比性原则、及时性原则、明晰性原则、权责发生制原则、收入与费用配比原则、划分收益性支出和资本性支出原则、谨慎性原则和重要性原则。
会计核算方法
企业会计制度和 小企业会计制度在会计科目设置和会计核算方法上基本相同，如资产计价方法都以取得时发生的货币支出，或以形成前所发生的料工费支出，或以换出非货币资产的账面价值加上应支付的相关税费，或以重组债权的账面价值，作为资产的入账价值。
总结：
小企业会计准则和企业制度在适用范围、侧重点、会计科目设置、账务处理、规范的目标和可操作性等方面存在明显的区别。企业会计准则更侧重于原则性和规范性，适用于大中型企业，而小企业会计准则则更侧重于简化操作和实用性，适用于经营规模较小的小企业。两者在制定依据、会计核算基础工作和前提条件、会计核算应遵循的基本原则以及会计核算方法等方面基本相同。
