国际本科互认和中外合作办学是两种不同的教育合作形式，它们在性质、办学主体、学籍管理服务、合作模式、招生方式、毕业文凭等方面存在明显的区别。
性质不同
中外合作办学：是指外国教育机构与中国教育机构在中国境内合作举办的，以中国公民为主要招生对象的教育机构。这些机构通常是独立设置的，有独立的校区和师资队伍，按照中外双方共同制定的教学计划培养学生。
国际本科学术互认课程：是国家留学基金管理委员会东方国际教育交流中心针对国内本科院校提供的系列教育国际化支持方案的启动项目。它不是独立的教育机构，而是一个项目，旨在通过国内本科阶段的学习，再前往国外合作院校继续完成后续课程，最终获得国外院校颁发的本科学士学位证书。
办学主体不同
中外合作办学：办学主体包括国外知名高校和对接的国内知名高校。这些合作可以是机构对机构，也可以是对项目。
国际本科学术互认课程：负责方主要是教育部国家留学基金管理委员会，联合国外知名高校和国际教育专家。
学籍管理服务不同
中外合作办学：由所在国内高校为学生国内外学习阶段提供统一的学籍管理服务。
国际本科学术互认课程：由国家留学基金委为学生国内外学习阶段提供统一的学籍管理服务。
合作模式不同
中外合作办学：常见的有中外合作办学机构和中外合作办学项目。合作办学机构通常是独立设置的，有独立的校区和师资队伍；合作办学项目一般依托国内高校的某个专业，引进国外优质的教学资源、课程体系等。
国际本科学术互认课程：一般采用一对多的模式，即国内一所大学对应国外多所大学，学生依据在国内阶段的学业表现与成绩，带着部分学分去挑选契合自身的国外院校继续学业。
招生方式不同
中外合作办学：分为计划内统招和计划外自主招生两种方式。计划内的中外合作办学需要参加全国统一高考并填报志愿，计划外的中外合作办学则通过自主招生，不需要参加高考。
国际本科：只有计划外自主招生一种方式，不需要参加高考，也不需填报高考志愿，通过学校内测的方式进行申请。
毕业文凭不同
中外合作办学：在满足特定条件时，学生有机会获得双证（中外双方学位证）；否则，毕业后仅能拿到外方文凭的单证。
国际本科：毕业后直接获得国外大学的本科学士学位证书，通常不获得国内高校的学位证书和毕业证书，但部分项目可能获得国内和国外双证，需经过教育部留学服务中心认证。
综上所述，中外合作办学和国际本科学术互认课程在多个方面存在显著差异，学生在选择时应根据自身情况和目标进行详细了解和选择。
