《S.C.I.谜案集》中的未解之谜包括：
展耀和赵爵的关系
展耀和白羽瞳第一次去见赵爵时，赵爵对展耀的态度与众不同，暗示他们关系不一般。
在魔法杀人案及最后的大胡子案件中，赵爵提到展耀虽然长得像展启天，但性格更像赵爵，引发观众对展耀身世的猜测。展耀究竟是谁的儿子成为了一个未解之谜。
赵爵的归宿和神秘能力
电视剧结尾，赵爵被某人用车带走并拷走，他提到时间对他没有任何意义，这让人怀疑他是否拥有不老不死的能力。赵爵的身份和最终去向成为未解之谜。
白磬堂的身世和遭遇
白磬堂称小时候对她开枪的人不是赵爵，那么究竟是谁对她开枪？她是否也是实验人？她的童年经历和背景存在诸多疑问。
白烨之谜
白烨的身份和命运充满谜团。白爹称白烨是他大哥，但白烨在白磬堂出生不久后就去世了。现在的白烨与小白长得一模一样，但又以白烨的身份存在，这引发了关于白烨身份和目的的猜测。有推测认为现在的白烨可能是以前那个白烨的实验品，被神秘组织制造出来的完美成品。
大白和小白的身世
大白和小白的身世也是未解之谜。他们与展爹和白爹的关系复杂，且大白失去记忆后以小白的身份出现，这背后的故事令人好奇。
这些未解之谜为《S.C.I.谜案集》增添了丰富的剧情和悬疑色彩，吸引了大量观众的兴趣。
