南京玄武中等专业学校拥有多个专业系部，其中包括艺术系、信息技术系和现代服务系等。根据提供的信息，以下是一些被普遍认为较好的专业：
艺术系：
包括美术绘画、音乐舞蹈等专业，这些专业为学生提供了艺术培养和创作的机会。
信息技术系：
计算机应用技术、计算机网络技术等专业，这些专业注重于计算机及相关设备的维护与维修、行业应用软件、平面图像处理、广告设计制作、动画制作、计算机网络及网站建设与管理。
现代服务系：
可能包括电子商务、休闲服务、美容美体等专业，这些专业为学生提供了与现代服务业相关的知识和技能。
数字媒体应用技术专业：
旨在培养电子竞技行业所需的技术型人才，涉及动画制作、游戏及影片包装等项目的策划与制作、动画创意设计、计算机仿真与艺术设计等领域。
选择哪个系部更好，取决于学生的个人兴趣和职业规划。建议学生根据自己的兴趣和未来的职业目标，选择最合适的专业系部进行深入学习。
