补充公积金的缴纳方式如下：
单位缴纳
申请与资格：用人单位需要向公积金管理中心提交申请，获得补充公积金的资格。
缴纳比例：补充公积金的缴存比例根据职工上一年度的月平均工资计算，一般不超过9%。
缴纳流程：单位在发放工资的5天之内，将补充公积金存入为职工设立的专门账户，并计入职工个人的公积金账户。
个人缴纳
申请与资格：如果所在单位没有补充公积金的缴纳资格或比例，个人可以自行申请补充公积金。个人需要向公积金管理中心提交申请，并提供相关证明材料。
缴纳比例：个人和单位补充住房公积金的缴存比例分别不得超过9%和不少于1%。
缴纳流程：个人在获得公积金管理中心审核通过后，需要按照规定的时间和方式，向公积金管理中心缴纳补充公积金。
线上办理
单位办理：单位可以通过公积金网上业务办理系统，选择“单位补充公积金账户设立”，填写相关信息并提交，系统会提示账户设立结果。
补缴申请：单位可以通过公积金管理中心的官方网站或相关平台进行补缴申请，录入补缴信息后提交审核，审核通过后进行支付确认。
注意事项
补充公积金的缴存比例和金额应根据当地政策和单位实际情况确定。
单位应当按时、全员、足额缴存补充公积金，不得逾期缴存、少缴或多缴。
建议：
用人单位应提前了解并遵守当地关于补充公积金的政策和规定，确保缴纳流程的顺利进行。
个人在申请补充公积金时，应确保所有材料的真实性和完整性，以便顺利通过审核。
