农村合作医疗（简称新农合）和医保（包括城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险等）在多个方面存在区别：
所覆盖的对象不同
新型农村合作医疗：只有农民才可以参加，必须以家庭为单位整户参加。
医保：包括城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险等，覆盖城市居民及企业职工。
缴费主体不同
合作医疗：缴费主体是农民个人、集体和政府，通过三方面筹资。
医保：缴费主体是劳动者和用人单位，通过这两方面筹资。
缴费方式不同
合作医疗：农民自愿参加，每年缴费，缴费标准固定。
医保：用人单位和职工共同缴纳，缴费标准与个人工资和当地平均工资挂钩。
保障范围不同
合作医疗：主要是广覆盖，但保障力度相对较低，报销比例和范围有限。
医保：保障性更强，报销比例较高，报销范围较广。
待遇不同
合作医疗：农民参加后，可享受住院费用报销和部分门诊费用报销，但报销比例和范围相对较小。
医保：包括住院费用报销、统筹病种门诊费用报销以及用于支付门诊医疗费的个人账户待遇，报销比例较高。
就医管理要求不同
合作医疗：农民需在指定的农村合作医疗定点医院就医才能享受报销待遇。
医保：参保人员需在医疗保险定点医院就医，部分地区也允许在非定点医院就医，但报销比例可能较低。
总的来说，农村合作医疗和医保在覆盖对象、缴费主体、缴费方式、保障范围、待遇和就医管理要求等方面存在明显的区别。农村合作医疗主要针对农村居民，缴费较低，保障力度有限；而医保则覆盖更广泛的城镇职工和居民，缴费较高，保障力度更强。随着政策的不断完善，两者的报销比例和范围也在逐步接近。
