北京二中目前有以下几个分校：
大兴亦庄分校：
成立于2011年，位于北京经济技术开发区，是一所12年一贯制公办学校。
通州分校：
成立于2011年，位于北京市通州区。
内蒙古集宁分校：
具体成立时间未提及，位于内蒙古集宁市。
北京铁路二中长阳加州水郡分校：
具体成立时间未提及，位于北京市房山区长阳镇。
金色石头叶子：
具体成立时间未提及，名称可能与分校有关。
克罗尼：
具体成立时间未提及，名称可能与分校有关。
北京市第二中学分校寄宿部：
具体成立时间未提及，提供寄宿教育服务。
北京二中分校北校区：
成立于2020年，位于北京市东城区和平里学区。
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