南通中等专业学校开设的轨道交通专业主要学习以下课程：
1. 轨道交通工程制图
2. 城市轨道交通概论
3. 地铁消防与安防系统
4. 地铁通风与制冷系统
5. 城市轨道交通售检票系统
6. 电梯原理与维修
7. 城市轨道交通运营组织
8. 地铁给排水系统
9. 城市轨道交通供电系统运行与维修
10. 城市轨道交通车辆检修
11. 视频监控系统
12. 城市轨道交通英语
13. 城市轨道交通行车组织
14. 城市轨道交通客运组织
15. 城市轨道交通票务管理
16. 城市轨道交通车站设备应用
17. 城市轨道交通运营安全
18. 城市轨道交通客运服务
19. 电工技术基础与技能
20. 电子技术基础与技能
21. 机械基础
22. 城轨信号基础设备维护
23. 城轨信号系统操作与检测
24. 轨道交通网络系统维护
25. 轨道交通联锁设备维护
26. 城轨列车运行控制系统维护
27. 城市轨道交通信号施工
专业培养目标是使学生掌握各类轨道建设工程的知识，能够在运营管理、城市通信、铁道工程等领域从事相应的工作。毕业生可服务于地铁运营公司、城市轻轨运营公司、交通客货场站等，从事车辆运行调度、车站管理、机电设备维护、电力机车维护与维修、安全运行监督等工作
