港澳通行证和签注是用于中国内地居民前往香港和澳门地区的两种重要文件，它们的区别主要体现在以下方面：
性质不同
港澳通行证：是大陆人民去香港澳门所必须办理的证件，相当于大陆居民的“护照”，用于证明持有人的身份和旅行资格。
签注：是对港澳通行证是否可以通关的审批，附在港澳通行证上，证明持有人有合法的理由和时间段前往香港或澳门。
必要性
港澳通行证：没有签注是不能去往香港和澳门的，它本身并不具备通关的权限，只是作为身份和旅行资格的证明。
签注：没有签注，即使有港澳通行证也不能通关，签注是通行证能否通关的必要条件。
内容
港澳通行证：是一种证件，通常是一本蓝黑色封皮的证件簿，上面记录持有人的个人信息和照片等。
签注：是印于港澳通行证内页的几行文字注解，注明持有人此次前往香港或澳门的目的、行程时间等信息。
种类
港澳通行证：根据不同的申请事由，签注分为多种类型，如个人旅游（G）、探亲（T）、商务（S）、团队旅游（L）、其他（Q）、逗留（D）等。
签注：每种签注都有不同的有效期限和次数限制，例如香港G签和L签的有效期有3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次等几种，澳门签注只有3个月1次、1年1次等。
有效期
港澳通行证：成年人的有效期为10年，未满16周岁的签发5年有效通行证。
签注：签注的有效期就是持有人此次可以逗留香港或澳门的总时间，每次在香港或澳门逗留不超过7天，一进一出算一次。
综上所述，港澳通行证和签注在性质、必要性、内容、种类和有效期等方面都有明显的区别。港澳通行证是大陆居民前往香港和澳门的必备身份证明，而签注则是通行证上的重要注释，用以证实持有人的访问目的和合法停留期限，两者缺一不可，且需获得内地公安部门的批准。
