截至当前时间，以下人物知道柯南的真实身份：
阿笠博士：
作为新一的朋友和发明家，阿笠博士是最早知道柯南真实身份的人之一。他不仅帮助新一隐瞒身份，还为柯南提供了许多高科技装备。
工藤优作 和 工藤有希子：
新一的父母，他们通过阿笠博士得知了柯南的真实身份，并在一些场合中配合演戏以保护新一。
服部平次：
作为与新一齐名的高中生侦探，服部平次通过推理和柯南的某些行为，最终确认了柯南的身份。
宫野明美：
黑衣组织成员，她在临死前从柯南口中得知了自己的真实身份。
灰原哀（宫野志保）：原黑衣组织成员，因服用APTX4869而变小，后与柯南一起行动，她自己也推理出柯南的真实身份。
贝尔摩德：
黑衣组织的重要成员，她通过观察和推理得知了柯南和小哀的真实身份。
本堂瑛祐：
在FBI与黑衣组织的对决中，他通过推理得知了柯南的真实身份。
冲矢昂：
他注意到了柯南使用变声器的情况，从而得知了柯南的真实身份。
诺亚方舟（泽田弘树）：
在剧场版《贝克街的亡灵》中，人工智能通过扫描柯南的大脑得知其真实身份。
爱尔兰：
在剧场版《漆黑的追踪者》中，他通过对比指纹得知柯南与工藤新一为同一人。
鲁邦三世：
在特别篇《名侦探柯南vs鲁邦三世》中，他似乎也察觉到了柯南的真实身份。
峰不二子：
同样在特别篇《名侦探柯南vs鲁邦三世》中，她可能也知道了柯南的真实身份。
安室透/降谷零：
在《名侦探柯南》的某些情节中，零通过推理和观察，对柯南的真实身份产生了怀疑。
这些角色在不同程度上知道柯南的真实身份，并在剧情中扮演了重要角色。
