种子萌发是一个由多个阶段组成的复杂过程，主要包括以下几个阶段：
吸胀阶段
种子在接触到水或潮湿环境时，其内部的亲水性物质会吸引水分子，导致种子体积迅速增大。这个过程开始时吸水速度较快，随后逐渐减慢。吸胀的结果使种皮变软或破裂，增加了种皮对气体和水的通透性，从而启动萌发过程。
水合与酶的活化阶段
吸胀阶段结束后，种子细胞的细胞壁和原生质发生水合，从凝胶状态转变为溶胶状态。各种酶开始活化，呼吸和代谢作用急剧增强。例如，大麦种子在吸胀后会释放赤霉素，诱导水解酶（如α-淀粉酶和蛋白酶）的合成，这些酶将胚乳中的淀粉和蛋白质分解成可溶性物质，供胚生长所需。
细胞分裂和增大阶段
随着细胞分裂和增大，胚开始生长，种子内贮存的营养物质开始大量消耗。这个阶段吸水量再次迅速增加，胚根和胚芽的生长加快。
胚突破种皮阶段
胚生长到一定体积后，会突破种皮外露。大多数种子先出胚根，接着长出胚芽。有些种子（如豌豆和蚕豆）的下胚轴不伸长，子叶留在土中，仅由上胚轴和胚芽长出土面形成幼苗，称为子叶留土幼苗。
长成幼苗阶段
胚根和胚芽继续生长，最终形成根、茎和叶，使种子变成独立的幼苗。幼苗逐渐适应环境，开始独立生活。
种子萌发是一个需要适宜温度、适量水分和充足空气的过程。温度过低会抑制呼吸作用，影响种子内部生理活动的正常进行。因此，适宜的环境条件对种子的萌发至关重要。
