农村合作社的申请流程如下：
工商行政管理局设立登记
提交材料：包括登记申请书、全体设立人签名盖章的设立大会纪要、全体设立人签名盖章的章程、法定代表人及理事的任职文件和身份证明、出资成员签名盖章的出资清单、法定代表人签署的成员名册和成员身份证明复印件、住所使用证明、指定代表或委托代理人的证明、合作社名称预先核准申请书、业务范围涉及前置许可的文件等。
领取营业执照：登记机关应当自受理登记申请之日起二十日内办理完毕，向符合登记条件的申请者颁发营业执照，登记类型为农民专业合作社。
公安局制定刻章
提交材料：合作社法人营业执照复印件、法人代表身份证复印件、经办人身份证复印件等。
收费：约400元上下。
质量技术监督局办理组织机构代码证
提交材料：合作社法人营业执照副本原件及复印件、合作社法人代表及经办人身份证原件及复印件、如受他人委托代办的，须持有委托单位出具的代办委托书面证明等。
收费：108元/证，工本费正本每份10元，副本每份8元，技术服务费90元。
国家、地方税务局申领税务登记证
提交材料：法人营业执照副本及复印件、组织机构统一代码证书副本及复印件、法定代表人（负责人）居民身份证或其他证明身份的合法证件复印件、经营场所房屋产权证书复印件、成立章程或协议书复印件等。
收费：免收税务登记工本费。
办理银行开户和账号
提交材料：法人营业执照正、副本及其复印件等。
当地农经主管部门备案
提交材料：可能需要提供合作社的相关文件、证件等。
建议：
在申请过程中，建议与政府相关部门多沟通，获取支持和指导，确保流程顺利进行。
准备好所有必要的文件，并按照要求提交，以确保一次性通过审核。
