《名侦探柯南》的大结局如下：
柯南恢复原形：
柯南通过各种线索和推理，最终找到了服用APTX 4869变小的解药，成功恢复为原来的身体——工藤新一。
新兰幸福生活：
新一和小兰在经历了一系列冒险和磨难后，终于坦诚相对，确认了彼此的感情，并幸福地生活在一起。
黑衣组织覆灭：
黑衣组织被消灭，灰原哀虽然没有成功研制出能够变回去的解药，但她选择将最后一粒解药留给小兰，默默祝福他们。
阿笠博士牺牲：
阿笠博士为了守护世界，英勇牺牲。
其他角色的结局：
工藤优作和有希子继续全世界乱跑写小说，服部平次表白成功，和叶纠结来纠结去结婚，最后当了大阪府警本部长。
少年侦探团的未来：
由于柯南和小哀的离去，少年侦探团最终解散。
这个结局满足了广大粉丝的期待，所有主要角色都得到了妥善的安排，故事在圆满中落下帷幕。
