《沙耶之歌》的结局主要有以下几种：
病院结局
沙耶治好了郁纪的病，但郁纪无法融入正常生活，被当成精神病关了起来。在郁纪用手机与沙耶告别后，沙耶永远消失。
全灭结局
耕司勇闯地下城，虽然击败了触手形态的遥和战斧郁纪，最后还是败给了BOSS沙耶。之后，沙耶和郁纪的孩子出世，全人类灭亡（据我看应该是人类都被感染了），另外医生完全被感染只是时间问题。
耕司和医生组队一同前往，医生用冷冻弹杀死了沙耶并被郁纪所杀，郁纪自杀，耕司疯了。
花开结局
沙耶牺牲自己，释放出无数的孢子，将世界改变成让郁纪感到幸福的样子。
另一个版本的病院结局
郁纪希望回到正常的生活，这句话狠狠地伤到沙耶的心，但沙耶依旧无私地治好郁纪的感官障碍，让脱离。最后，郁纪在精神病院的窗户旁等待着沙耶的归来，而沙耶决定独自去寻找她的“父亲”。
这些结局各有其独特的悲剧色彩，体现了游戏深刻的情感和主题。建议玩家根据自己的喜好选择不同的结局来体验。
